👀 Тут на Kaggle приехала интересная биологическая задачка - Novozymes Enzyme Stability Prediction

😓 Предлагается по аминокислотной последовательности белка фиксированный длины предсказать температуру плавления.

🤓 В общем, просят реализовать AlphaFold от DeepMind на минималках. AlphaFold предсказывал 3D структуру, а тут все намного проще - надо всего лишь температуру плавления.

🤔 Что-то похожее я уже решал однажды в прошлой жизни биоинформатика. Посмотрел, как люди на форуме пытаются решить эту задачу и там какой-то детский сад. По типу tf-idf + модель. Очевидно, это никак не раскрывает свойства такого сложного 3D объекта как белок.

👨‍🚒 Решил, что буду участвовать. Хочу усилить свою команду и провести эксперимент. Ищу новых тиммейтов с биологическим бэкграундом!

👨🏻‍🌾 Я ищу именно тебя, если ты:
- Понимаешь основы молекулярной биологии. Отличаешь ДНК от аминокислот.
- Имеешь опыт аннотации белков.
- Любишь ресерчить статейки и даже слышал, как устроен AlphaFold.

🧞‍♂️ С меня вся ML часть. Ресурсы и личный соревновательный опыт. В планах пойти "каглерским" путем. Настакать фичей разной природы и дальше по классике ансамбль бустинга, сетки и линеек.

✅ Пиши в личку, если тебе интересна задача и нужны медали на Kaggle! Думаю, что особенно актуально для тех кто переходит из биоинфы в DS/ML.