Google представили AlphaProtein Novo - пайплайн, который проектирует ферменты с нуля под нужную реакцию.
Веса модели и код открыты для некоммерческого использования опубликованы. Препринт.
До сих пор DeepMind в основном предсказывала структуру белков с помощью AlphaFold и собирала связывающие белки с помощью AlphaProteo.
А сейчас они выпускают
AlphaProtein Novo - пайплайн для дизайна ферментов под малые молекулы, разработанный Google DeepMind совместно с лабораториями Frances Arnold (нобелевский лауреат по химии 2018 года) и Peng Liu.
Систему сначала проверили на стандартных модельных реакциях в собственной лаборатории, а потом вместе с группами Frances Arnold и Peng Liu на двух прикладных задачах.
Авторы отмечают, что дизайн с нуля даёт удачные стартовые точки для направленной эволюции, а данные эволюции улучшают следующие раунды дизайна.
Post #13469
660