Вау! TERRA - это 1-я мировая модель для тканей человека

Институт Сэнгера потратил 1,5 года на создание фундаментальной модели для пространственной транскриптомики, то есть универсального атласа того, как работают ткани человека на клеточном уровне.

Она построена на одном из самых крупных корпусов человеческих данных, собранных на сегодняшний день.

TERRA - это попытка сделать для тканей человека то, что GPT сделал для текста.

Модель одновременно понимает 3 уровня: что делает ген в конкретной клетке, каков тип и состояние самой клетки, и как устроено её микроокружение.

Архитектурно модель близка к JEPA ЛеКуна.

Модель уже нашла в поджелудочной железе новое сосудистое состояние, предположительно предшественник зрелой сети островков Лангерганса.

Также выявила макрофагальную нишу на границе опухоли, которая коррелирует с плохой выживаемостью при раке почки.

Модель обучена на 112 миллионах клеток из пространственной транскриптомики, охватывает 20 тканей, 26 заболеваний, стадии развития и норму. Примерно две трети данных- собственные, новые.

Модель, код открыты.