Выпущена 1-я в мире универсальная клеточная ИИ-модель, её создала команда Цукерберга.

Исследователи из Chan Zuckerberg Initiative и Stanford University представили TranscriptFormer – ИИ-модель для анализа одноклеточных транскриптомов, охватывающую 1.53 млрд лет эволюционной истории. Модель здесь.

Эта работа представляет переход от статичных клеточных атласов к интерактивным генеративным моделям клеточной биологии.

TranscriptFormer обучена на 112 млн клеток из 12 видов: от человека и мыши до рыбы-зебры, мух, червей, дрожжей и даже малярийного паразита. В отличие от предыдущих моделей, она может не только анализировать данные, но и генерировать новые профили экспрессии генов.

Ключевые инновации:

1. Генеративная природа - модель создает вероятностное распределение над генами и их уровнями экспрессии
2. Эволюционный охват-интеграция данных через огромные эволюционные расстояния.
3. Виртуальный инструмент-возможность проводить "цифровые эксперименты" через запросы к модели
4. Контекстуализированные эмбеддинги генов - уникальный способ представления генов в их клеточном контексте

Вот какие возможности это дает:

- Классификация типов клеток даже для видов, отделенных 685 миллионами лет эволюции
- Определение болезненных состояний клеток
- Перенос знаний между видами без дополнительного обучения
- Предсказание факторов транскрипции и взаимодействий между генами

TranscriptFormer прокладывает путь к "виртуальной клетке" – всеобъемлющей вычислительной модели клеточных процессов, способной отвечать на сложные биологические вопросы.

Ранее Chan Zuckerberg Initiative
уже представили в этом направлении проекты: -платформу для работы с одиночными клетками.
-платформу, объединяющую ИИ и клеточные исследования.