#ГОТ_ИХБФМ #NGS #анализ_данных
Группа омиксных технологий ИХБФМ СО РАН готова помочь в анализе данных секвенирования различного типа:
• Полногеномные данные человека и других организмов: поиск вариаций, сборка генома de novo, выявление крупных геномных перестроек, в том числе по данным Oxford Nanopore;
• Таргетное NGS: поиск вариаций, мутаций, клиническая аннотация, отбор патогенных вариантов;
• Транскриптомные данные: сравнение уровня экспрессии генов между образцами, статистическая обработка данных;
• Метагеномные данные: анализ представленности микроорганизмов, сравнение представленности между образцами.
Можем оказать помощь или приготовить соответствующие NGS-библиотеки как коммерческими наборами, так и собственными, уже описанными в литературе, благодаря чему возможно потратить на реактивы в 2–10 раз меньше по сравнению с коммерческими наборами.
Возможна разработка пайплайнов, программного обеспечения для анализа данных NGS как для научного, так и коммерческого применения. Для анализа данных в распоряжении коллектива лаборатории собственный вычислительный кластер. По вопросам сотрудничества обращаться: aa_kechin@1bio.ru.