В норме, когда желудок пуст, в нем каждые 1,5–2 часа запускается так называемый мигрирующий моторный комплекс (ММК). Это мощные мышечные сокращения, которые работают как веник — они очищают желудок и кишечник от остатков пищи, слизи и бактерий. Именно эти сокращения воздуха и жидкости мы и слышим как урчание.
При простуде иммунные белки (цитокины) подавляют активность блуждающего нерва, который управляет ЖКТ. Сигнал к запуску «веника» просто не поступает, и желудок замирает.

Обычно урчание сопровождается выделением небольшого количества желудочного сока.
Гормоны стресса (например, кортизол), которые всегда повышены при инфекции, снижают выработку желудочного сока и тормозят перистальтику.