в детстве мне нравился фильм Обитель зла: страшные псы, смешные зомби, конечно же Йовович и Родригес в секси-нарядах, и дух зомби-апокалипсиса в целом. последнее кажется универсальный сюжет, который по душе многим.
и кажется, у нас будет возможность испытать его на себе 🐱
в Science вышла работа, в которой исследователи из Стэнфорда и Arc Institute с помощью генеративных моделей Evo спроектировали целые геномы бактериофагов — вирусов, заражающих бактерии.
схема проста и прекрасна: языковые модели обучили на огромном количестве генетических последовательностей и попросили написать новые варианты генома одного из фагов. потом исследователи отобрали 302 предложенных варианта, синтезировали соответствующую ДНК и проверили их в бактериях.
16 вариантов оказались рабочими: они собирались в полноценные вирусные частицы, размножались внутри бактерий и убивали их. некоторые справлялись даже лучше природного варианта, а смесь искусственных фагов смогла поражать бактерии, которые уже приобрели устойчивость к исходному вирусу.
кайфово звучит? однозначно да. и с этим связана интересная деталь.
генеративный ИИ не просто предложил молекулу, белок или отдельный кусок ДНК. это LLM умели и до этого. он написал целый геном, который после синтеза превратился в штуку, способную самостоятельно размножаться внутри клетки. и в целом делать это бессконтрольно 🥳
пока можно немного расслабиться: речь идёт о крошечных бактериофагах, которые заражают бактерии, а не клетки людей. сгенерированный фаг содержит всего около 5,4 тысячи нуклеотидов. человеческий геном, например, больше примерно в миллион раз.
но теперь proof of concept существует. и нам с этим жить.
авторы статьи конечно подчеркивают вопросы биобезопасности. потому что генерация работающих геномов одновременно выглядит как очень крутой инструмент для фаговой терапии и как технология, для которой хотелось бы придумать правила чуть раньше, чем она станет действительно мощной и распространённой. хотя с последним будет сложно — с биологической точки зрения это достаточно простая задача и
так что да, антибиотикорезистентность мы, возможно, победим ИИ-сгенерированными фагами. правда есть вероятность новых интересных пандемий и надеюсь зомби-апокалипсиса. должны же как-то пригодится тренировки и опыт скитания по горам и лесам.
удивительно, но тут подходит завершение прошлого поста: аминь 🐱