В JMH-тесте на Apple M4 Max заполнение массивов ссылок заняло у G1 139 мс, а у ParallelGC 0,5 мс. При этом сборка мусора не запускалась: почти всё время ушло в JIT-код
Arrays.fill.Причина: барьер записи, который JVM добавляет к каждому присваиванию ссылки. Он помечает изменённые участки кучи, чтобы G1 не сканировал всё старое поколение. На результат также повлияли размер регионов G1 и переход массива в старое поколение.
Разбор JMH-бенчмарка и ARM64-инструкций HotSpot объясняет, почему одной инструкции оказалось недостаточно. Замедление относится к этой конфигурации: перед настройкой G1 повторите замер на своей нагрузке.